柯南和小五郎等拉着大队，来到位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”渡假。这座岛屿自古已有流传，大概有关沉没于海底的古代遗迹“海底宫殿”，及300年前两名女海盗遗留下来的宝藏传说。小兰和园子不惧流传，在“海底宫殿”附近潜水时，意外遇到一大群正在寻找宝物的猎人，不料其中一人突然遭鲨鱼攻击，不幸身亡！小兰和园子幸运逃难，柯南见那位猎人死状诡异，与灰原一起展开调查。柯南认为猎人之死，跟宝藏传说有着莫大关系，他试图解开背后原因，“海底宫殿”的谜题一直系绕在他的脑海中。他找到了一组神秘名词“Jolly Roger(海盗旗)”后，满以为有所起色，猎人却突然现身，并偷走了原来发现的宝藏！小兰和园子落在猎人的魔掌之中，性命危在旦夕！隐藏于传说中的讯息是什么？“海底宫殿”有什么秘密？穿越300年时光的暗号，柯南誓要逐步解开迷题
杰森·苏戴奇斯 比尔·哈德尔 乔什·加德 丹尼·麦克布莱德 彼特·丁拉基 妮琪·米娜 斯特林·K·布朗 莱斯莉·琼斯 奥卡菲娜 蕾切尔·布鲁姆 扎克·伍兹 欧赫尼奥·德尔维斯 里尔·莱尔·哈瓦瑞 德芙·卡梅隆 贝克·班尼特 布鲁克琳·普林斯 阿尔玛·瓦萨诺 菲丝·玛格丽特·基德曼-厄本 桑迪·萝丝·厄本 吉妮西丝·坦尼翁
普鲁内尔·查尔斯·安布隆 恩佐·拉齐托 纳塔莉・德赛 布鲁诺·帕维奥 杰里米·洛佩兹 哈里森·阿雷瓦洛 尼古拉斯·潘切瓦 蒂莎·达维拉·本萨拉 米歇尔·伊莱亚斯 帕斯卡尔·佩斯特尔 保罗·班迪 伊莎贝尔·嘉德 莉莲娜·罗维埃 卡里姆·姆里巴 奥利维耶·克拉弗里 伊丽莎白·杜达
豪尔赫·乌松 Fernando Ramos Luis Enrique de Tomás Cyril Corral Pepa Gracia Rachel Lascar Gabriel Latorre Alex Martos Philipp Nowicki Victor Nuñez Fermín Núñez